解决办法：

1、停止服务器

2、在server控制台内，在服务器上点右键--属性

3、general选项卡中点switch location

这时，location变为:/servers/tomcat6.0 server at localhost.server

4、在project explore中找到tomcat项目--Tomcat v6.0 Server at localhost.server  这个文件 ，双击打开

5、在最下面的server option里选中publis module context to separate xml file.保存。